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艰难梭菌(C. difficile)是一种可以感染大肠的细菌，症状从腹泻到危及生命的结肠损伤不等。美国威斯康星大学麦迪逊分校的Ophelia Venturelli及其同事于11月<>日发表在PLOS Biology上的一项研究表明，肠道微生物组内的物种间相互作用可能会影响旨在治疗艰难梭菌感染的抗生素的疗效。

艰难梭菌感染发生在复杂的居民肠道群落的背景下。然而，旨在消除细菌的抗生素治疗是基于艰难梭菌对单一栽培药物的敏感性测量而设计的，而不考虑其与其他细菌的相互作用。

为了更好地了解不同微生物群落中改变易感性的微生物相互作用，研究人员进行了实验，以测试用于治疗艰难梭菌感染的两种抗生素万古霉素和甲硝唑在不同人类肠道群落中的有效性。为了确定物种间相互作用的生态学原理，他们建立了一个计算模型来了解微生物相互作用和抗生素对艰难梭菌生长的相互作用。

研究人员发现，比艰难梭菌更容易受到测试抗生素影响的细菌物种允许艰难梭菌在没有生态竞争的情况下生长，并在甲硝唑亚致死浓度存在的情况下增加艰难梭菌的丰度。作者还发现，特定细菌物种的存在使艰难梭菌对甲硝唑具有耐受性。该研究仅限于两种抗生素，因此未来的研究应优先考虑种间相互作用如何影响其他临床相关药物的疗效。

根据作者的说法，“这些结果为影响这一健康相关系统中抗生素敏感性的生态原理和分子机制提供了关键见解。我们的工作表明，病原体的生长可以通过各种抗生素浓度的物种间相互作用来改变，这在抗生素治疗的设计中应该考虑。

Venturelli补充说：“人类肠道病原体艰难梭菌(C. difficile)嵌入到密集而多样化的人类肠道群落中，影响其定植能力，生长和功能。使用自下而上的社区组装方法，我们证明艰难梭菌对临床相关抗生素的反应可以通过抗生素诱导的细菌竞争强度降低或在共生肠道物种Desulfovibrio猪的存在下艰难梭菌细胞状态的全球变化来改变。